Hola, e visto que la respuesta es de hace mucho, pero por si alguien cae por aqui , voy a dar una solución que despues de estar unas cuantas horas pegandome con el dotnetnuke e descubierto.
Cuando usas el modulo de Banners de Dnn, desde "vendors" (vendedores) añades los banners agrupandolos por nombre de grupo, pero por alguna razon los swf no me salian, pero las imagenes si (jpeg, gif, png etc) pues bien la solución es bien sencilla... hay que ponerle un ancho y alto al objeto que estais añadiendo. asi apareceran sin problemas.
Un saludo y espero que sirva esto para algo ;)